El Doctorado en Ingeniería de Los Andes es el primer posgrado del país en obtener acreditación de calidad por parte del Ministerio de Educación Nacional, que lo avaló por un periodo de seis años. De acuerdo con el Consejo Nacional de Acreditación (CNA), organismo encargado de este proceso, el Ministerio reconoce de esta manera la "calidad del programa, la organización, su funcionamiento y el cumplimiento de su función social".

En su resolución, el Ministerio destacó que los 28 profesores de tiempo completo del programa tienen título doctoral, cuentan con reglamentación estricta para valorar las tesis doctorales y han realizado una "excelente producción académica" con cerca de 135 publicaciones durante los últimos cinco años en revistas indexadas y libros, con el apoyo de los estudiantes que han participado en el proceso.

De acuerdo con la acreditación, el programa busca la calidad en un nivel "comparable al de universidades de talla mundial" y, por ello, se resaltan los 19 grupos de investigación interdisciplinarios y la experiencia de la Facultad en este ámbito, así como los convenios existentes con cerca de 30 instituciones educativas e investigativas para intercambiar visitas y pasantías de investigación para estudiantes y profesores.

El Doctorado en Ingeniería fue creado en 1998 con resolución 2418 del MEN, obtuvo su registro calificado el 20 de diciembre de 2010 mediante resolución 11173 y comprende las áreas de Sistemas, Industrial, Civil y Ambiental, Eléctrica y Electrónica, Química y Mecánica.

Junto con la acreditación, el CNA hizo recomendaciones sobre el mejoramiento en materia de patentes, registros industriales, modelos de utilidad e innovaciones tecnológicas.

Actualmente, el Doctorado cuenta con un fondo administrado por la Facultad de Ingeniería que busca asegurar el desarrollo del programa y de sus estudiantes mediante financiación por parte de Colciencias, Icetex, Colfuturo y comisiones de estudio. De esta manera, se ha logrado una deserción inferior a 5%.

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